Após chegar ao clube na reta final de 2018, como auxiliar técnico de Milton Mendes, Thiago Duarte logo foi bem acolhido por funcionários e torcedores. O profissional deixou o clube há um mês e agora retorna em uma nova função.
Thiago será Coordenador Técnico do Santa Cruz. Com o intuito de fazer uma integração entre as categorias de base e o profissional. A função era feita por Ataíde Macêdo, que deixou o clube após a Série C.
Com a mudança e modernização do departamento de futebol, Thiago Duarte também vai implementar o Núcleo de Inteligência do Futebol.